Jak diagnostikovat bakteriální choroby

Metoda pro vizuální analýzu příznaků

Ve většině případů není možné určit bakteriální choroby vizuální metodou. Je to možné pouze v případech, kdy jsou příznaky specifické. Přítomnost exsudátu často naznačuje bakteriální povahu nekrózy..

Metoda barvení mikroskopickou analýzou

Lék je připraven z tkání, které jsou mezi zdravou a nemocnou tkání. Díky barvení (například podle Grama) je možné rozeznat bakteriální buňky v tkáni hostitelské rostliny.

Mikrobiologická metoda

Příčinná látka je izolována z nemocné tkáně rostliny a pěstována na umělém živném médiu. Pouze v tomto případě je nutné stanovit patogenitu bakteriálních izolátů, tj. Schopnost patogenu způsobovat rostliny, které jsou uměle infikovány, stejné příznaky, jaké byly na vyšetřované rostlině v důsledku přirozeného poškození. To znamená, že jednají v souladu s pravidlem Roberta Kocha, kterému se říká Kochova triáda. Metoda se skládá ze tří fází: izolace patogenu, infekce rostliny a izolace patogenu z ní.

Sérologická metoda

Podstata metody je stejná jako v diagnostice virů. Rozdíly v sérologické diagnostice bakterií od diagnózy virů spočívají v tom, že kromě proteinů, které jsou specifické pro daný druh, mají bakteriální buňky také proteiny, které jsou společné pro rod a rodinu bakterií. Proto, aby se získalo specifické antisérum, používají se pouze druhově specifické proteiny nebo antigeny. Nejoblíbenějšími sérologickými metodami jsou enzymaticky vázaná imunosorbentová zkouška a imunofluorescenční reakce. V současné době existují cenově dostupné dianogostické soupravy, pomocí kterých můžete identifikovat infekci semen rajčat bakteriální rakovinou.

Molekulární metoda

Mezi diagnostické metody, které jsou založeny na použití polymorfismu molekuly DNA bakterií, patří mezi nejčastější amplifikace druhově specifických sekvencí DNA během polymerázové řetězové reakce (PCR). Metoda je založena na syntéze („množení“) jednotlivých fragmentů DNA, které jsou charakteristické pouze pro jeden typ bakterií. Fragment DNA lze „násobit“ stovky, tisíce a milionykrát, vše záleží na specifikách konkrétního typu diagnózy. Fragment je dále detekován elektroforézou na agarózovém gelu nebo fluorescencí původního roztoku.

Metoda je velmi citlivá (pro diagnostiku postačí 10-11 g bakteriální DNA), rychlá (5-8 hodin), vysoce spolehlivá, přesná (100). Nevýhody lze připsat pouze vysokým nákladům na činidla a vybavení, což znamená vysoké náklady na samotnou diagnostiku. Pro diagnostiku bakterií pomocí PCR je také důležité předběžně studovat rozmanitost DNA FPB.